Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ThpoP40226 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms