Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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