Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RxraP28700 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RxraP28700 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RxraP28700 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RxraP28700 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RxraP28700 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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