Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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