Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prim1P20664 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prim1P20664 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms