Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms