Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl13aP19253 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms