Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fv4P11370 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms