Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01748 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01748 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01748 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01748 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01748 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01748 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01748 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01748 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01748 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01748 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01748 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P01748 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P01748 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P01748 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms