Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp100O35892 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp100O35892 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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