Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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