Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmiO35309 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NmiO35309 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NmiO35309 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NmiO35309 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NmiO35309 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NmiO35309 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmiO35309 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmiO35309 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms