Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GclmO09172 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GclmO09172 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GclmO09172 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms