Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Degs1O09005 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms