Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Smyd1-201ENSMUST00000074301 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ddx24-206ENSMUST00000221211 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 AC107711.5-201ENSMUST00000228149 594 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms