Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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