Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ssxb8B1AY40 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ssxb8B1AY40 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ssxb8B1AY40 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ssxb8B1AY40 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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