Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR5

Tcf23, Transcription factor 23, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf23Q9JLR5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Tcf23Q9JLR5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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Tcf23Q9JLR5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Tcf23Q9JLR5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Tcf23Q9JLR5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tcf23Q9JLR5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Tcf23Q9JLR5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms