Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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