Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Chrac1Q9JKP8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms