Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Tspan4Q9DCK3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tspan4Q9DCK3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms