Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms