Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ap5s1Q9D742 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms