Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Snx29Q9D3S3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Snx29Q9D3S3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Snx29Q9D3S3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx29Q9D3S3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx29Q9D3S3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx29Q9D3S3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx29Q9D3S3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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