Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Mrpl28Q9D1B9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Mrpl28Q9D1B9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Mrpl28Q9D1B9 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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