Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms