Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc47Q9D024 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc47Q9D024 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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