Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms