Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Utp23Q9CX11 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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