Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Khdc3Q9CWU5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Khdc3Q9CWU5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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