Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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