Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms