Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubqln4Q99NB8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms