Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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