Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ubxn4Q8VCH8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ubxn4Q8VCH8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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