Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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FgbQ8K0E8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FgbQ8K0E8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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FgbQ8K0E8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FgbQ8K0E8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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