Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkn3Q8K045 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms