Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phc3Q8CHP6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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