Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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