Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp27Q8CEG8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms