Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp20Q8C6M1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp20Q8C6M1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp20Q8C6M1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp20Q8C6M1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp20Q8C6M1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp20Q8C6M1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp20Q8C6M1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp20Q8C6M1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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