Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pggt1bQ8BUY9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pggt1bQ8BUY9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pggt1bQ8BUY9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pggt1bQ8BUY9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pggt1bQ8BUY9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pggt1bQ8BUY9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pggt1bQ8BUY9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pggt1bQ8BUY9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Pggt1bQ8BUY9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pggt1bQ8BUY9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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