Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms