Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nmes1Q810Q5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nmes1Q810Q5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nmes1Q810Q5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Nmes1Q810Q5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Nmes1Q810Q5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Nmes1Q810Q5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nmes1Q810Q5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms