Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Clec18aQ7TSQ1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Clec18aQ7TSQ1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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