Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Eci3Q78JN3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Eci3Q78JN3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms