Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
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NipblQ6KCD5 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NipblQ6KCD5 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
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