Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gbf1Q6DFZ1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gbf1Q6DFZ1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gbf1Q6DFZ1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gbf1Q6DFZ1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gbf1Q6DFZ1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gbf1Q6DFZ1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gbf1Q6DFZ1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gbf1Q6DFZ1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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