Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PtprdQ64487 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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