Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms